Martin Selmayr (Bonn, 5 december 1970) is een Duits jurist. Selmayr is vanaf november 2014 kabinetschef van de Europese commissie onder Jean-Claude Juncker.
Selmayr studeerde rechten aan de universiteiten van Genève en Passau, aan King's College London en aan de Universiteit van Californië, in Davis en Berkeley. In 2001 promoveerde hij aan de Universiteit van Passau met het proefschrift "Das Recht der Wirtschafts- und Währungsunion". Van 1998 tot 2000 werkte Selmayr voor de Europese Centrale Bank in Frankfurt am Main. In 2001 ging hij voor Bertelsmann werken.
In 2004 ging Selmayr voor de Europese commissie werken en werd commissiewoordvoerder voor Informatiemaatschappij en media, waarvoor Viviane Reding politiek verantwoordelijk was. Van februari 2010 tot juni 2014 was Selmayr kabinetschef van Reding in haar functie als vicevoorzitter van de Europese commissie en EU-commissaris voor Justitie, grondrechten en burgerschap.
In april en mei 2014 nam Selmayr verlof van de Europese commissie en leidde de verkiezingscampagne van Jean-Claude Juncker, kandidaat voor de Europese Volkspartij. Sinds juli 2014 leidt Selmayr het overgangsteam van Juncker in aanloop naar de nieuwe commissie Juncker, waar Selmayr kabinetschef zal zijn.